晋哀帝兴宁元年（癸亥，公元363年）春季，二月，己亥（疑误），东晋实行大赦，改年号为兴宁。

三月，壬寅（十七日），皇太妃周氏死于琅邪的宅第。癸卯（十八日），哀帝前往周氏宅第办理丧事，诏令司徒会稽王司马昱总揽朝廷内外的各种事务。哀帝想为太妃居丧三年，仆射江陈述说：“根据礼制，应该服三个月的缌麻丧。”哀帝又想降低一等，居丧一年，江说：“抑制和暂时委屈自己的私人感情，这是为了尊奉祖先。”于是哀帝就穿缌服以示居丧。

夏季，四月，前燕宁东将军慕容忠攻打荥阳太守刘远，刘远逃奔到鲁阳。

五月，东晋让征西大将军桓温担任侍中、大司马、都督中外诸军事、录尚书事，并给予他持黄钺的礼遇。桓温任命抚军司马王坦之为长史。王坦之是王述的儿子。又任命征西掾郗超为参军，王为主簿，每件事情一定要和这俩人商量。王府里的人称他们是：“长胡子参军，矮个子主簿，能让桓公高兴，也能让桓公愤怒。”桓温气概清高卓越，很少有他所推重的人，和郗超谈论，常常自己说郗超深不可测，而尽心敬待他。郗超也很认真地与桓温交往。王是王导的孙子，他和谢玄都是桓温的辅佐掾吏，桓温对他们都很看重。桓温说：“谢玄年庙四十必定会拥旗执节，王当成为少壮而居高位的黑头公，全都是不可多得的人才。”谢玄是谢奕的儿子。

东晋任命西中郎将袁真为都督司、冀、并三州诸军事，任命北中郎将庾希为都督青州诸军事。

癸卯（十九日），前燕人攻下了密城，刘远逃奔到江陵。

秋季，八月，有异星出现在角宿、亢宿。

张玄靓的祖母马氏去世，尊奉庶母郭氏为太妃。郭氏因为张天锡专擅朝政，与大臣张钦等人谋划要杀掉他。事情泄露，张钦等人全都自杀。张玄靓十分害怕，要把王位让给张天锡，张天锡不接受。右将军刘肃等人劝张天锡自立为王。闰八月，张天锡让刘肃等人趁夜率兵闯进王宫，杀掉了张玄靓，公开宣布时则说他突然死亡，定谥号为冲公。张天锡自称使持节、大都督、大将军、凉州牧、西平公，时年十八岁。尊奉母亲刘美人为太妃。派司马纶骞带着奏章去建康请求指令，同时送御史俞归东返建康。

冬季，十月，前燕镇南将军慕容尘在长平攻打陈留太守袁披。汝南太守朱斌乘虚袭击许昌，许昌被攻克。

代王拓跋什冀犍攻击高车，把他们打得大败。俘获一万多人，马、牛、羊一百多万头。

东晋任命征虏将军桓冲为江州刺史。十一月，姚襄的旧将张骏杀掉了江州督护赵毗，率领他的兵众反叛，桓冲讨伐并斩杀了张骏。

晋哀帝兴宁二年（甲子，公元364年）二月，前燕太傅慕容评、龙骧将军李洪率军巡视黄河以南。

三月，庚戌朔（初一），东晋大规模地核查户数人口，命令以所居之地作为编注户口、纳税服役的依据，并严格法律制度。此项法令称为“庚戌制”。

哀帝相信了方术之士的话，不吃饭仅吃药以求长生不老。侍中高崧劝谏说：“这不是帝王应该干的事。如果这样，陛下实在就像出现日食月食一样犯了过失。”哀帝不听劝谏。辛未（二十二日），哀帝因为药性发作，不能亲临政事，褚太后又临朝摄政。

夏季，四月，甲辰（二十五日），前燕李洪攻打许昌、汝南，在悬瓠打败了东晋的军队，颍川太守李福战死。汝南太守朱斌逃奔到寿春，陈郡太守朱辅退守彭城。大司马桓温派西中郎将袁真等人抵御李洪，桓温自己率领水军驻扎在合肥。于是前燕人攻下了许昌、汝南、陈郡，将一万多户百姓迁徙到幽州、冀州，派镇南将军慕容尘驻扎在许昌。

五月，戊辰（二十日），东晋任命扬州剌史王述为尚书令。让大司马桓温担任扬州牧、录尚书事。壬申（二十四日），派侍中召桓温入朝参政，桓温辞让不来。

王述每当接受任命，都不虚情假意地辞让，他表示推辞的，就肯定不接受。到他做尚书令时，儿子王坦之告诉他：“根据惯例，应当表示辞让。”王述说：“你认为我不胜任吗？”王坦之说：“不是，只是能辞让自然是件好事。”王述说：“既然认为能够胜任，为什么又要辞让！人们都说你比我强，我看肯定赶不上我。”

六月，前秦王苻坚派大鸿胪授予张天锡大将军、凉州牧、西平公。

秋季，七月，丁卯（二十日），东晋下达诏令，再一次征召大司马桓温入朝。八月，桓温抵达赭圻，朝廷诏令尚书车灌劝阻他，于是桓温就以赭坼为城住了下来，固