唐生智在接管南京后开始对全城开展了一次从头到尾的排查工作，首先清除的就是日军潜伏在南京的特务。因此把整个南京城搞得满城风雨。大校场机场同时也正式戒严。独立团只能在现有的空间内展开训练。经过一个星期的训练加入独立团的新兵基本上掌握了开枪射击的技巧。同时唐生智积极整合在南京的部队，并将弹药悉数发放给部队。所以独立团的战士们基本上每一名战士都分到了一支枪。

至此南京保卫战逐渐拉开序幕守卫南京的中国军地编制如下：南京卫戍司令长官部唐生智担任司令长官周斓担任参谋长，罗卓英、刘兴分别担任副司令长官；余念慈担任副总参谋长；下辖徐福泉第二军团、叶肇六十六军、王敬九七十一军、俞济时第七十四军、宋希廉第七十八军、邓龙光第八十三军、罗卓英第十八军、桂永清的教导总队、谷正伦的宪兵部队以及直属炮兵、骑兵、工兵等部。其中主要的作战将领分别是：唐生智、罗卓英、王敬九、孙元良、桂永清、萧山令等。由于很多部队都没满编，因此加起来中国军队总兵力只有八万余人，并且将近三分之二都是新兵。

进攻南京的日军编制如下：华中方面军总司令松井石根；参谋长塚田攻副参谋长武藤章，北路兵团下辖武田进第三师团、山室宗武的第十一师团、狄洲立兵第十三师团、伊东政喜第101师团以及重藤支队。南路兵团则有柳川平助担任司令官，下辖谷寿夫的第六师团、牛岛贞熊的第十八师团、佐贺终治的114师团。以及第三飞行团河海军第三舰队一部支援作战，总兵力三十余万。

虽说现在唐生智接管了南京的具体防务，但让唐生智等人头疼的是此时蒋介石却没有一点想要离开的意思。这着实是让唐生智头疼。并不是蒋介石不想走，因为蒋介石知道他这一走不知道什么时候还会回来。他太留念这座城市了，他是在南京夺取了中国的最高领导权，也正是从这里东征西讨打败了各路的军阀。眼下就要离开这座城市蒋介石心理真的别有一番滋味。正所谓“古国回首不堪月明中”事实上蒋介石不走的原因还有一点那就是给日军和南京的卫戍部队制造一种假象，毕竟中国最高掌权者还没有离开那就说明中国军地誓死要在南京和日军决一死战。

一九三七年十一月二十号日本东京陆军参谋总部正式颁布战斗序列废除原先作战目的，命令华中方面军在海军的协同下攻占中国首都南京。在经过数日的准备后华中方面军司令官松井石根下达了攻占南京的命令。至此一场载入史册的战役正式爆发。

随着东京的一声令下和中国军队在锡澄防线对峙的日军不费吹灰之力突破中国军队防守的锡澄防线，胡宗南部被日军打的七零八落。唐生智给胡宗南的命令是守住锡澄防线半个月左右，让唐生智觉得气愤的是作为中央军将领的胡宗南压根就没有把他这个卫戍司令放在眼里，仅仅抵抗了六天便率部撤退，锡澄防线失守日军就可谓兵临南京城下。唐生智只好无奈的去找蒋介石诉苦。但出于对胡宗南的爱护只好敷衍着说道：“孟萧呀，这个问题不大，锡澄防线注定是守不住的，我们只要在南京打好了就行。”唐生智只好打碎牙往肚子里咽。在中央军中流行着一句话：打了败仗老头子要是怪罪下来只要抱着老头子的大腿痛哭嘴上说着誓死效忠校长之类的话蒋介石就会原谅那些打了败仗的将军。这次唐生智终于体会到了。

眼看着日军很快就要兵临南京城下唐生智只好匆忙的调集部队。南京中国军队的指挥部内唐生智焦急的在指挥部内走来走去，南京城外隆隆的枪炮声清晰的传到指挥部内每一个人耳朵之中。就在这时通讯兵大声的喊道：“报告司令官，日军三个师团的兵力正在进攻浦口、汤山镇、龙潭镇等地，我军请求支援。”

“等了这么久小鬼子你们真算是真的来了。”唐生智听着隆隆的炮火自言自语的说道。罗卓英也连声的说道：“司令官小日本给我们留下的时间可不多了。”唐生智笑着回答道：“罗将军是我们给小鬼子留下的时间不多了。说完后唐生智趴在地图上用红色铅笔在浦口、汤山镇等地死死的圈了起来。他转过头对问道：“防守浦口的是哪支部队？是川军饶国华部和滇军卢汉所部。唐生智想了想对站在身边的落罗卓英说道：“三个师团进攻浦口估计饶国华和卢汉有点吃力，要不然让十八军上吧。”

当罗卓英听了唐生智的话后有点疑惑的问道：“司令孙元良部距离浦口只有三个小时的路程我觉得孙元良的七十二军更加适合。”在浦口安排川军并没有刻意的将杂牌部队放在最前沿。因此唐生智要求十八军前去增援只是单纯的考虑到罗卓英