初重用琅琊王氏，一个王敦主外，一个王导主内，现在好了，全国四分之三的兵力都归王敦把控，四分之三的朝臣不是王氏的人就是与王氏密切相关的人，自王导成了丞相，这种大权旁落的感觉让司马睿心中愈加岌岌可危，“王与马，共天下”的说法，更加说明主弱臣强的政治格局，司马睿有时候就觉得自己像是一个门阀世族的傀儡，他当然不心甘，于是重用那些家族势力不强的人，比如戴渊，刘隗，刁协等等，而这些人也是不受王导待见的，原因很简单，因为他们没什么背景，他们在别无选择的情况下，只有尽心尽力为司马睿效忠。

刘隗和刁协搞了一系列的封建典章礼仪制度，其主要目的就是要加强皇权，抑制权臣，王导王敦会高兴么？一开始这种制度还是收到了成效，那就是“用申韩而救世”，“以法御下”，坚持排抑豪强，不避权贵的原则，对不守封建礼教，不遵法度和上侵皇权的行为进行坚决的打击，被他俩搞掉的人很多，什么王籍之，颜含，宋挺，梁龛，阮抗等等，纷纷遭到弹劾，不是免官就是充军。

而这种做法和王导的“镇之以静”，“宁使网漏吞舟”的扶持纵容门阀势力的做法产生了很大的冲突...王导一直都知道王敦有野心，他是反对的，而这次，他与王敦站在了一起。

王敦暗自给王导通信，信中的一个主题就是“清君侧..”，这次王导选择了沉默。